Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
E9PMD0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E9PMD0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
E9PMD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
E9PMD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E9PMD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
E9PMD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
E9PMD0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
E9PMD0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
E9PMD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
E9PMD0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E9PMD0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
E9PMD0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E9PMD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
E9PMD0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E9PMD0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E9PMD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E9PMD0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
E9PMD0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
E9PMD0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
E9PMD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
E9PMD0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
E9PMD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
E9PMD0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E9PMD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
E9PMD0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
E9PMD0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms