Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC2Q9Y235 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
APOBEC2Q9Y235 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
APOBEC2Q9Y235 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms