Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SALL3Q9BXA9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SALL3Q9BXA9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SALL3Q9BXA9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms