Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
USB1Q9BQ65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USB1Q9BQ65 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
USB1Q9BQ65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms