Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SMAD5Q99717 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD5Q99717 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD5Q99717 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms