Protein–RNA interactions for Protein: Q96HG1

SMIM10, Small integral membrane protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10Q96HG1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMIM10Q96HG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMIM10Q96HG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMIM10Q96HG1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms