Protein–RNA interactions for Protein: Q92622

RUBCN, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNQ92622 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNQ92622 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNQ92622 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNQ92622 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUBCNQ92622 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms