Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PNPLA1Q8N8W4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PNPLA1Q8N8W4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PNPLA1Q8N8W4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms