Protein–RNA interactions for Protein: Q12149

RRP6, Exosome complex exonuclease RRP6, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP6Q12149 GUD1YDL238C 1470 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 MSS1YMR023C 1581 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 VPS24YKL041W 675 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 AST1YBL069W 1290 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 SCS22YBL091C-A 528 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 HXT2YMR011W 1626 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 SEC18YBR080C 2277 nt6.67□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 PTR2YKR093W 1806 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 CDC1YDR182W 1476 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 BSC5YNR069C 1470 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 SIT1YEL065W 1887 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 PMP3YDR276C 168 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 RFA2YNL312W 822 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 YDR514CYDR514C 1452 nt6.66□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 ECM14YHR132C 1293 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 AAT2YLR027C 1257 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 YPR123CYPR123C 435 nt6.65□□□□□ -1.34
RRP6Q12149 APM1YPL259C 1428 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 WHI2YOR043W 1461 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 CNE1YAL058W 1509 nt6.65□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YIL092WYIL092W 1902 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 OSW2YLR054C 2175 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RSA3YLR221C 663 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 TEP1YNL128W 1305 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 IVY1YDR229W 1362 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 CRF1YDR223W 1404 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 HXT15YDL245C 1704 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 HXT16YJR158W 1704 nt6.64□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 PEX7YDR142C 1128 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 STB5YHR178W 2232 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 MRS1YIR021W 1092 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YLR184WYLR184W 348 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RDL2YOR286W 450 nt6.63□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 CHL4YDR254W 1377 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 OPI7YDR360W 435 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YMR122CYMR122C 375 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YOL163WYOL163W 510 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RRS1YOR294W 612 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 MNN5YJL186W 1761 nt6.62□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RPT3YDR394W 1287 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 MSP1YGR028W 1089 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 PRE2YPR103W 864 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YPR150WYPR150W 522 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 KKQ8YKL168C 2175 nt6.61□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RGD1YBR260C 2001 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 EMW1YNL313C 2715 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 RPN5YDL147W 1338 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 CDC34YDR054C 888 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 PSR2YLR019W 1194 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YEF1YEL041W 1488 nt6.6□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 HXT17YNR072W 1695 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YET3YDL072C 612 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 TFG2YGR005C 1203 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 BCY1YIL033C 1251 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 MRS3YJL133W 945 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 SRN2YLR119W 642 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 TSA1YML028W 591 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 SCS7YMR272C 1155 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 YLL067CYLL067C 3618 nt6.59□□□□□ -1.35
RRP6Q12149 CSC1YLR241W 2349 nt6.59□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 SLX5YDL013W 1860 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 HST3YOR025W 1344 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YEL068CYEL068C 333 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YGR291CYGR291C 222 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 OAC1YKL120W 975 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YML131WYML131W 1098 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 GLN1YPR035W 1113 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 PYK2YOR347C 1521 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 MDM31YHR194W 1740 nt6.58□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 EFT2YDR385W 2529 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 EFT1YOR133W 2529 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 FRS2YFL022C 1512 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 MAK31YCR020C-A 267 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YEA6YEL006W 1008 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YGL072CYGL072C 360 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 KRE9YJL174W 831 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 TDH2YJR009C 999 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 MRPL24YMR193W 777 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 PHA2YNL316C 1005 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 DIT1YDR403W 1611 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 DDC1YPL194W 1839 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 VPS5YOR069W 2028 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 POP1YNL221C 2628 nt6.57□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 VPS4YPR173C 1314 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 RPN11YFR004W 921 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 LDS1YAL018C 978 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 MDH1YKL085W 1005 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 DRE2YKR071C 1047 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 MED4YOR174W 855 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 COA2YPL189C-A 207 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YPR114WYPR114W 948 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 IFA38YBR159W 1044 nt6.56□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 YMR155WYMR155W 1644 nt6.55□□□□□ -1.36
RRP6Q12149 RPE1YJL121C 717 nt6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 89.6 ms