Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 ALT2YDR111C 1524 nt5.68□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 HSP78YDR258C 2436 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 YPK2YMR104C 2034 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 CCP1YKR066C 1086 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 RNH201YNL072W 924 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 KEL1YHR158C 3495 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 KEX2YNL238W 2445 nt5.67□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 YDL129WYDL129W 876 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 RPS2YGL123W 765 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 LEU5YHR002W 1074 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 RPN7YPR108W 1290 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 GPB2YAL056W 2643 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 GUA1YMR217W 1578 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 YDR387CYDR387C 1668 nt5.66□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 YDR109CYDR109C 2148 nt5.65□□□□□ -1.5
YHC1Q05900 AIM3YBR108W 2844 nt5.65□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 DIA3YDL024C 1407 nt5.65□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 HAS1YMR290C 1518 nt5.64□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 COX20YDR231C 618 nt5.64□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.64□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 SCO2YBR024W 906 nt5.64□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 IVY1YDR229W 1362 nt5.64□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 APE3YBR286W 1614 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YEH1YLL012W 1722 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YER186CYER186C 921 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 DJP1YIR004W 1299 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 GCV3YAL044C 513 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 STM1YLR150W 822 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 PUS5YLR165C 765 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 HAL5YJL165C 2568 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 MTC5YDR128W 3447 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YPL277CYPL277C 1464 nt5.63□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 MAK32YCR019W 1092 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 CIN4YMR138W 576 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YOL131WYOL131W 327 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YOR300WYOR300W 309 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 ATP1YBL099W 1638 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 BZZ1YHR114W 1902 nt5.62□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 TIM22YDL217C 624 nt5.61□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 FHN1YGR131W 525 nt5.61□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YML082WYML082W 1950 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 LSG1YGL099W 1923 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 KDX1YKL161C 1302 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 ADE12YNL220W 1302 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YDL057WYDL057W 987 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 SEC20YDR498C 1152 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 KSS1YGR040W 1107 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 BUD32YGR262C 786 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 LYS12YIL094C 1116 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 IMD1YAR073W 1212 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 UBC11YOR339C 471 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 SKN1YGR143W 2316 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 RGT2YDL138W 2292 nt5.6□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 PTK2YJR059W 2457 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 SKS1YPL026C 1509 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 QNS1YHR074W 2145 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 NPA3YJR072C 1158 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 YLR184WYLR184W 348 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 AMA1YGR225W 1782 nt5.59□□□□□ -1.51
YHC1Q05900 QDR3YBR043C 2070 nt5.59□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.58□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 FYV1YDR024W 486 nt5.58□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YIL077CYIL077C 963 nt5.58□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.58□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 PRI2YKL045W 1587 nt5.58□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YEL020CYEL020C 1683 nt5.57□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 ATO3YDR384C 828 nt5.57□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 GAL83YER027C 1254 nt5.57□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 MRPS5YBR251W 924 nt5.57□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 SAC6YDR129C 1929 nt5.56□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 CHO1YER026C 831 nt5.56□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 ZRT2YLR130C 1269 nt5.56□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 CIT3YPR001W 1461 nt5.56□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 SNU71YGR013W 1863 nt5.56□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 VRP1YLR337C 2454 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YHC3YJL059W 1227 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 HSP150YJL159W 1242 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 MOG1YJR074W 657 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YBR144CYBR144C 315 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 GPA1YHR005C 1419 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 MID1YNL291C 1647 nt5.55□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 LDB19YOR322C 2457 nt5.54□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 CSM2YIL132C 642 nt5.54□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 MLC2YPR188C 492 nt5.54□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 ALD6YPL061W 1503 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 IDP1YDL066W 1287 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 GFD1YMR255W 567 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 RPS9AYPL081W 594 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 RBD2YPL246C 789 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 SSK22YCR073C 3996 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 SMF2YHR050W 1650 nt5.53□□□□□ -1.52
YHC1Q05900 MNS1YJR131W 1650 nt5.52□□□□□ -1.53
YHC1Q05900 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt5.51□□□□□ -1.53
YHC1Q05900 YER010CYER010C 705 nt5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.3 ms