Protein–RNA interactions for Protein: P40080

VFA1, VPS4-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1P40080 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 OAC1YKL120W 975 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 TAF11YML015C 1041 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 ATP4YPL078C 735 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 TFC6YDR362C 2019 nt6.49□□□□□ -1.37
VFA1P40080 GPB2YAL056W 2643 nt6.48□□□□□ -1.37
VFA1P40080 UTP4YDR324C 2331 nt6.48□□□□□ -1.37
VFA1P40080 FSF1YOR271C 984 nt6.48□□□□□ -1.37
VFA1P40080 SPS22YCL048W 1392 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 GAT1YFL021W 1533 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 MRS3YJL133W 945 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YJU3YKL094W 942 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 YPR150WYPR150W 522 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 APM4YOL062C 1476 nt6.47□□□□□ -1.37
VFA1P40080 RAD3YER171W 2337 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 ERP5YHR110W 639 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 DOT5YIL010W 648 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RNH201YNL072W 924 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 YNR040WYNR040W 771 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RAD24YER173W 1980 nt6.46□□□□□ -1.38
VFA1P40080 CSC1YLR241W 2349 nt6.45□□□□□ -1.38
VFA1P40080 CHS5YLR330W 2016 nt6.45□□□□□ -1.38
VFA1P40080 SKI2YLR398C 3864 nt6.45□□□□□ -1.38
VFA1P40080 XBP1YIL101C 1944 nt6.45□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RPS28AYOR167C 204 nt6.45□□□□□ -1.38
VFA1P40080 PAT1YCR077C 2391 nt6.44□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RPS5YJR123W 678 nt6.44□□□□□ -1.38
VFA1P40080 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.44□□□□□ -1.38
VFA1P40080 COA2YPL189C-A 207 nt6.44□□□□□ -1.38
VFA1P40080 ARO10YDR380W 1908 nt6.43□□□□□ -1.38
VFA1P40080 BUR6YER159C 429 nt6.43□□□□□ -1.38
VFA1P40080 QRI5YLR204W 336 nt6.43□□□□□ -1.38
VFA1P40080 DRS1YLL008W 2259 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 YFL042CYFL042C 2025 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 AFG1YEL052W 1530 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RPL10YLR075W 666 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 TAL1YLR354C 1008 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 YNR048WYNR048W 1182 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 YIL055CYIL055C 1884 nt6.42□□□□□ -1.38
VFA1P40080 GIT1YCR098C 1557 nt6.41□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RGT2YDL138W 2292 nt6.41□□□□□ -1.38
VFA1P40080 CIN4YMR138W 576 nt6.41□□□□□ -1.38
VFA1P40080 OPT1YJL212C 2400 nt6.41□□□□□ -1.38
VFA1P40080 CMR1YDL156W 1569 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RPL7AYGL076C 735 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 HAP2YGL237C 798 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 DJP1YIR004W 1299 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 RPL7BYPL198W 735 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 PRE2YPR103W 864 nt6.4□□□□□ -1.38
VFA1P40080 ERC1YHR032W 1746 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YIL092WYIL092W 1902 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 CBT1YKL208W 816 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 MRPL24YMR193W 777 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 ESC8YOL017W 2145 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 SSK22YCR073C 3996 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 HSP78YDR258C 2436 nt6.39□□□□□ -1.39
VFA1P40080 COX20YDR231C 618 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 RME1YGR044C 903 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YLR184WYLR184W 348 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YFL052WYFL052W 1398 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 CNM67YNL225C 1746 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YCR061WYCR061W 1896 nt6.38□□□□□ -1.39
VFA1P40080 IES1YFL013C 2079 nt6.37□□□□□ -1.39
VFA1P40080 CLB2YPR119W 1476 nt6.37□□□□□ -1.39
VFA1P40080 DIA3YDL024C 1407 nt6.37□□□□□ -1.39
VFA1P40080 GCV3YAL044C 513 nt6.37□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YPK2YMR104C 2034 nt6.37□□□□□ -1.39
VFA1P40080 HXT2YMR011W 1626 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 APE3YBR286W 1614 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 RRP1YDR087C 837 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YDR109CYDR109C 2148 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YER186CYER186C 921 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 RPS2YGL123W 765 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 IMD1YAR073W 1212 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 PYC1YGL062W 3537 nt6.36□□□□□ -1.39
VFA1P40080 ICE2YIL090W 1476 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 CLB1YGR108W 1416 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 TOS2YGR221C 1869 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YDL129WYDL129W 876 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 EAF5YEL018W 840 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 GAL83YER027C 1254 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 YNL194CYNL194C 906 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 PRP40YKL012W 1752 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 HIR1YBL008W 2523 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 KEX2YNL238W 2445 nt6.35□□□□□ -1.39
VFA1P40080 PAP1YKR002W 1707 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 PDR18YNR070W 4002 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 MMS21YEL019C 804 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 BUD32YGR262C 786 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 NAT5YOR253W 531 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 GUA1YMR217W 1578 nt6.34□□□□□ -1.39
VFA1P40080 MTC5YDR128W 3447 nt6.34□□□□□ -1.4
VFA1P40080 YEH1YLL012W 1722 nt6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.6 ms