Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 RGD1YBR260C 2001 nt5.78□□□□□ -1.48
SEF1P34228 CDC34YDR054C 888 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 SDH4YDR178W 546 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ADK2YER170W 678 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 AST1YBL069W 1290 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YNL120CYNL120C 486 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 TOS6YNL300W 309 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ELC1YPL046C 300 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RCK1YGL158W 1539 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 BSC5YNR069C 1470 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 UTP9YHR196W 1728 nt5.77□□□□□ -1.49
SEF1P34228 KEL1YHR158C 3495 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RVB2YPL235W 1416 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YPT1YFL038C 621 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 DOT5YIL010W 648 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ECM19YLR390W 339 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 GLC8YMR311C 690 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 DOM34YNL001W 1161 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RDL1YOR285W 420 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RPL5YPL131W 894 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 SKI2YLR398C 3864 nt5.76□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YLL067CYLL067C 3618 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 HEM2YGL040C 1029 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 GTO3YMR251W 1101 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 CWC25YNL245C 540 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 LDB16YCL005W 771 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 SAC6YDR129C 1929 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RMD9YGL107C 1941 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 TRP5YGL026C 2124 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 SKN1YGR143W 2316 nt5.75□□□□□ -1.49
SEF1P34228 MTF2YDL044C 1323 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 DYS1YHR068W 1164 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YJR107WYJR107W 987 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YNL228WYNL228W 777 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ENV7YPL236C 1095 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ECM31YBR176W 939 nt5.74□□□□□ -1.49
SEF1P34228 AVO1YOL078W 3531 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 ARG81YML099C 2643 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 CLB4YLR210W 1383 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 BUD32YGR262C 786 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 QNS1YHR074W 2145 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 RSA3YLR221C 663 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 SHP1YBL058W 1272 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 GLE1YDL207W 1617 nt5.73□□□□□ -1.49
SEF1P34228 MKC7YDR144C 1791 nt5.72□□□□□ -1.49
SEF1P34228 MSY1YPL097W 1479 nt5.72□□□□□ -1.49
SEF1P34228 YDL218WYDL218W 954 nt5.72□□□□□ -1.49
SEF1P34228 FBA1YKL060C 1080 nt5.72□□□□□ -1.49
SEF1P34228 APM1YPL259C 1428 nt5.72□□□□□ -1.49
SEF1P34228 PAT1YCR077C 2391 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PEX7YDR142C 1128 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 SQT1YIR012W 1296 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 CIS3YJL158C 684 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MEH1YKR007W 555 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 ELA1YNL230C 1140 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YPR150WYPR150W 522 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 LSG1YGL099W 1923 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PTR2YKR093W 1806 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YPR204WYPR204W 3099 nt5.71□□□□□ -1.5
SEF1P34228 BZZ1YHR114W 1902 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 AIM24YJR080C 1185 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YJR084WYJR084W 1272 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 AAT2YLR027C 1257 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 SRN2YLR119W 642 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 HMT1YBR034C 1047 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YIL092WYIL092W 1902 nt5.7□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PPT1YGR123C 1542 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 THI2YBR240C 1353 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PPM1YDR435C 987 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YEA6YEL006W 1008 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 COX17YLL009C 210 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MRPL24YMR193W 777 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YNL285WYNL285W 372 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MRPS12YNR036C 462 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 ESC8YOL017W 2145 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 RPN5YDL147W 1338 nt5.69□□□□□ -1.5
SEF1P34228 IMA5YJL216C 1746 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 CRF1YDR223W 1404 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 DUG1YFR044C 1446 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YGR291CYGR291C 222 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YLR126CYLR126C 756 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PDB1YBR221C 1101 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 GEX2YKR106W 1848 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YEF1YEL041W 1488 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 FET3YMR058W 1911 nt5.68□□□□□ -1.5
SEF1P34228 PCS60YBR222C 1632 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YDR015CYDR015C 240 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 RPP1YHR062C 882 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MRS3YJL133W 945 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 HSP150YJL159W 1242 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MTC2YKL098W 1074 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 YLR312CYLR312C 1197 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 RFA2YNL312W 822 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 RKI1YOR095C 777 nt5.67□□□□□ -1.5
SEF1P34228 MED4YOR174W 855 nt5.67□□□□□ -1.5
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