Protein–RNA interactions for Protein: P26368

U2AF2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF2P26368 ALDH7A1-232ENST00000637272 2554 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.496e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-231ENST00000637206 2466 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.56e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-216ENST00000635851 2135 ntTSL 511.65□□□□□ -0.546e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-236ENST00000638008 1865 ntTSL 510.8□□□□□ -0.686e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-227ENST00000636879 2501 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-212ENST00000509459 538 ntTSL 59.72□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-202ENST00000412186 555 ntTSL 39.16□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-218ENST00000635933 3247 ntTSL 58.73□□□□□ -1.016e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-214ENST00000511266 1812 ntTSL 58.2□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-213ENST00000510111 719 ntTSL 36.74□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 ALDH7A1-207ENST00000479989 598 ntTSL 44.71□□□□□ -1.666e-7■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 RAP1A-203ENST00000433097 666 ntTSL 518.48■□□□□ 0.551e-14■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.011e-14■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.021e-14■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 RAP1A-204ENST00000494982 1083 ntTSL 59.01□□□□□ -0.971e-14■■■■■ 34.9
U2AF2P26368 NUDT21-201ENST00000300291 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.697e-8■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 NUDT21-202ENST00000563362 449 ntTSL 26.79□□□□□ -1.327e-8■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 NUDT21-204ENST00000566340 581 ntTSL 35.56□□□□□ -1.527e-8■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 CLASP2-222ENST00000494261 764 ntTSL 45.99□□□□□ -1.453e-13■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 PRPF4B-206ENST00000481109 2364 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.372e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 PRPF4B-203ENST00000463634 2590 ntTSL 59.37□□□□□ -0.912e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)6.9□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 PRPF4B-202ENST00000461612 629 ntTSL 24.1□□□□□ -1.752e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 TP53BP1-217ENST00000605155 610 ntTSL 414.62□□□□□ -0.074e-18■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-203ENST00000429403 709 ntTSL 521.11■□□□□ 0.971e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-205ENST00000455168 1641 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.571e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-202ENST00000419534 1684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.061e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 ARL8B-206ENST00000468010 452 ntTSL 51□□□□□ -2.251e-11■■■■■ 34.8
U2AF2P26368 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.164e-20■■■■■ 34.7
U2AF2P26368 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.464e-20■■■■■ 34.7
U2AF2P26368 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.474e-20■■■■■ 34.7
U2AF2P26368 PLSCR4-211ENST00000498625 593 ntTSL 48.02□□□□□ -1.138e-7■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.147e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.137e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 USP53-203ENST00000507597 503 ntTSL 322.86■■□□□ 1.255e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 EML3-204ENST00000419857 578 ntTSL 421.55■■□□□ 1.045e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-217ENST00000483814 563 ntTSL 221.4■■□□□ 1.025e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.985e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.835e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 VPS52-214ENST00000463486 925 ntTSL 520.02■□□□□ 0.85e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-213ENST00000480227 2353 ntTSL 1 (best)19.79■□□□□ 0.765e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.735e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IRD1-207ENST00000489094 2274 ntTSL 519.5■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-206ENST00000469851 661 ntTSL 519.46■□□□□ 0.715e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-225ENST00000562297 2040 ntTSL 519.21■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 VPS52-215ENST00000464425 1060 ntTSL 519.15■□□□□ 0.665e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-234ENST00000567946 1822 ntTSL 518.91■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IP12-203ENST00000635323 939 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.65e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-204ENST00000595112 745 ntTSL 318.23■□□□□ 0.517e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-207ENST00000595548 801 ntTSL 218.06■□□□□ 0.487e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.445e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.415e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-206ENST00000520125 570 ntTSL 517.52■□□□□ 0.45e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 RSAD1-205ENST00000509398 539 ntTSL 417.48■□□□□ 0.395e-15■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-206ENST00000595258 672 ntTSL 517.36■□□□□ 0.377e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-212ENST00000489738 426 ntTSL 217.21■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.325e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-207ENST00000471603 2505 ntTSL 517■□□□□ 0.315e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-220ENST00000487932 6464 ntTSL 516.93■□□□□ 0.35e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.255e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-222ENST00000496574 4419 ntTSL 516.49■□□□□ 0.235e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-202ENST00000415938 3386 ntTSL 516.15■□□□□ 0.185e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 EML3-209ENST00000466671 565 ntTSL 415.93■□□□□ 0.145e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-220ENST00000475339 812 ntTSL 215.4■□□□□ 0.065e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.055e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 EML3-210ENST00000466886 599 ntTSL 415.32■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-211ENST00000483879 711 ntTSL 315.29■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.025e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 KHSRP-210ENST00000599395 837 ntTSL 515.14■□□□□ 0.017e-17■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-219ENST00000486339 4443 ntTSL 514.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PKD1-216ENST00000483731 4193 ntTSL 514.49□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PIGG-215ENST00000508562 570 ntTSL 414.48□□□□□ -0.095e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-203ENST00000409033 3701 ntTSL 1 (best)14.2□□□□□ -0.145e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-205ENST00000427008 735 ntTSL 313.99□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 UBR4-213ENST00000483922 543 ntTSL 513.99□□□□□ -0.175e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-207ENST00000520180 417 ntTSL 513.87□□□□□ -0.195e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.25e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 UBR4-211ENST00000467272 891 ntTSL 513.27□□□□□ -0.295e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.35e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-213ENST00000615914 411 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-214ENST00000621538 645 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-203ENST00000422087 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-210ENST00000476592 660 ntTSL 511.96□□□□□ -0.495e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 PNPLA8-201ENST00000257694 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.515e-8■■■■■ 34.6
U2AF2P26368 NPM2-210ENST00000522813 565 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.68□□□□□ -0.545e-8■■■■■ 34.6
Retrieved 100 of 36,523 protein–RNA pairs in 580.6 ms