Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CA4P22748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CA4P22748 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CA4P22748 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CA4P22748 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CA4P22748 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CA4P22748 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CA4P22748 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CA4P22748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA4P22748 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA4P22748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA4P22748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA4P22748 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CA4P22748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA4P22748 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA4P22748 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA4P22748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CA4P22748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA4P22748 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA4P22748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CA4P22748 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CA4P22748 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CA4P22748 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CA4P22748 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CA4P22748 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CA4P22748 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CA4P22748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CA4P22748 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA4P22748 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA4P22748 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA4P22748 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CA4P22748 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA4P22748 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA4P22748 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA4P22748 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CA4P22748 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CA4P22748 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA4P22748 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CA4P22748 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CA4P22748 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA4P22748 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CA4P22748 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA4P22748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA4P22748 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA4P22748 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA4P22748 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CA4P22748 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CA4P22748 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA4P22748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CA4P22748 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.8 ms