Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CSTAP01040 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CSTAP01040 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CSTAP01040 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CSTAP01040 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTAP01040 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTAP01040 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CSTAP01040 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTAP01040 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTAP01040 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTAP01040 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTAP01040 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSTAP01040 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSTAP01040 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTAP01040 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTAP01040 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTAP01040 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSTAP01040 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSTAP01040 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSTAP01040 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTAP01040 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTAP01040 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSTAP01040 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSTAP01040 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTAP01040 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTAP01040 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSTAP01040 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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