Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXY3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXY3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A0A0J9YXY3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
A0A0J9YXY3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A0A0J9YXY3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms