Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

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Length 1,094 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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SEC24CP53992 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SEC24CP53992 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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