Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC24CP53992 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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