Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3GALT2U3KPV4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
A3GALT2U3KPV4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3GALT2U3KPV4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms