Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED17Q9NVC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED17Q9NVC6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MED17Q9NVC6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms