Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HPS4Q9NQG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HPS4Q9NQG7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HPS4Q9NQG7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms