Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSU72Q9NP77 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSU72Q9NP77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SSU72Q9NP77 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSU72Q9NP77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms