Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ROPN1BQ9BZX4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ROPN1BQ9BZX4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ROPN1BQ9BZX4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms