Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YTHDF1Q9BYJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
YTHDF1Q9BYJ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
YTHDF1Q9BYJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YTHDF1Q9BYJ9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms