Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3GL3Q99963 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3GL3Q99963 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3GL3Q99963 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms