Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF9

SRFBP1, Serum response factor-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFBP1Q8NEF9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SRFBP1Q8NEF9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRFBP1Q8NEF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRFBP1Q8NEF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SRFBP1Q8NEF9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.7 ms