Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SAMD5Q5TGI4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SAMD5Q5TGI4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SAMD5Q5TGI4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms