Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN3Q58A45 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PAN3Q58A45 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PAN3Q58A45 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms