Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC6Q16204 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC6Q16204 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC6Q16204 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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