Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 RHOF-207ENST00000546227 1219 ntTSL 523.61■■□□□ 1.376e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.276e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 RHOF-206ENST00000545544 826 ntTSL 518.18■□□□□ 0.56e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 RHOF-205ENST00000541657 1626 ntTSL 518.07■□□□□ 0.486e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.36e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.252e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 MAST2-202ENST00000372008 2528 ntTSL 513.92□□□□□ -0.182e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 MAST2-207ENST00000482881 858 ntTSL 39.57□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 HLA-C-205ENST00000466892 754 nt17.87■□□□□ 0.452e-6■■■■□ 24.4
NOLC1Q14978 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 311.69□□□□□ -0.542e-9■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.02□□□□□ -1.931e-323■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 226.2■■□□□ 1.781e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 225.98■■□□□ 1.751e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-207ENST00000462188 1735 ntTSL 218.03■□□□□ 0.481e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)16.37■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 FAM117A-209ENST00000513602 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-201ENST00000335025 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-203ENST00000406385 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.541e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 PPIL2-204ENST00000417788 4213 ntTSL 211.31□□□□□ -0.61e-7■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-205ENST00000586592 2214 ntTSL 227.43■■□□□ 1.987e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.957e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 215.69■□□□□ 0.17e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.057e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.077e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-218ENST00000592364 576 ntTSL 512.72□□□□□ -0.377e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.687e-8■■■■□ 24.3
NOLC1Q14978 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.065e-13■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.321e-7■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.711e-7■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.2□□□□□ -1.741e-7■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.167e-9■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.577e-9■■■■□ 24.2
NOLC1Q14978 EIF3H-201ENST00000276682 2041 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.841e-10■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 EIF3H-212ENST00000611080 1265 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-10■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.461e-10■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-203ENST00000502762 2356 ntTSL 1 (best)24.25■■□□□ 1.471e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-209ENST00000630114 1433 ntTSL 522.56■■□□□ 1.21e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.641e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)18.89■□□□□ 0.611e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.111e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.681e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.081e-17■■■■□ 24.1
NOLC1Q14978 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 229.35■■■□□ 2.296e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.936e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.776e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-205ENST00000586859 703 ntTSL 315.62■□□□□ 0.096e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-212ENST00000602720 2037 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.076e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-203ENST00000542536 1714 ntTSL 213.58□□□□□ -0.246e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 SRP68-208ENST00000588736 2532 ntTSL 211.4□□□□□ -0.586e-13■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 CKS1B-207ENST00000477676 602 ntTSL 34.94□□□□□ -1.622e-25■■■■□ 23.9
NOLC1Q14978 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 521.2■□□□□ 0.987e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.797e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.787e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-203ENST00000404284 2622 ntTSL 218.53■□□□□ 0.567e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.547e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.487e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.5□□□□□ -1.371e-323■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 NOL11-209ENST00000583108 2071 ntTSL 211.62□□□□□ -0.552e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 NOL11-206ENST00000581375 2448 ntTSL 29.37□□□□□ -0.912e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 NOL11-210ENST00000584032 612 ntTSL 27.01□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 NOL11-208ENST00000583021 443 ntTSL 26.34□□□□□ -1.392e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.977e-8■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-201ENST00000318787 1350 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.414e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.134e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-209ENST00000609477 564 ntTSL 415.64■□□□□ 0.094e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.094e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-205ENST00000608456 624 ntTSL 37.75□□□□□ -1.174e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 HDDC2-208ENST00000609021 3529 nt5.64□□□□□ -1.514e-14■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-9■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 CAMSAP1-204ENST00000460094 371 ntTSL 26.63□□□□□ -1.352e-9■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-201ENST00000381683 1599 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.422e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-210ENST00000464790 583 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-211ENST00000476955 583 ntTSL 59.47□□□□□ -0.892e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.972e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-212ENST00000477256 1708 ntTSL 58.63□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-206ENST00000439997 787 ntTSL 56.98□□□□□ -1.292e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 EIF3L-205ENST00000436452 574 ntTSL 46.19□□□□□ -1.422e-6■■■■□ 23.8
NOLC1Q14978 TAF1D-221ENST00000540232 483 ntTSL 35.42□□□□□ -1.541e-82■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.678e-7■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.068e-7■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)24.04■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)24.04■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.442e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)22.99■■□□□ 1.272e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.752e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.682e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 RECQL4-201ENST00000301323 781 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 23.7
NOLC1Q14978 RECQL4-204ENST00000531875 988 ntTSL 517.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 23.7
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