Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.111e-7■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-7■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 TMEM9-208ENST00000472411 2892 ntTSL 211.6□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-203ENST00000525455 919 ntTSL 316.13■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.178e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-202ENST00000524819 1053 ntTSL 315.99■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-206ENST00000531944 1556 ntTSL 514.37□□□□□ -0.118e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-205ENST00000527435 868 ntTSL 211.65□□□□□ -0.548e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 POLR2G-204ENST00000526368 710 ntTSL 28.48□□□□□ -1.058e-8■■■■■ 42.3
PABPC4Q13310 CNBP-206ENST00000502372 1026 ntTSL 512.78□□□□□ -0.365e-24■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.179e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.959e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.59e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.089e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-207ENST00000476175 682 ntTSL 28.21□□□□□ -1.19e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 PRMT5-226ENST00000557443 337 ntTSL 36.18□□□□□ -1.429e-10■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 NECAB3-211ENST00000485399 1373 ntTSL 225.19■■□□□ 1.626e-8■■■■■ 42.2
PABPC4Q13310 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-207ENST00000520188 1967 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-203ENST00000396774 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.355e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-215ENST00000523343 467 ntTSL 310.2□□□□□ -0.785e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-204ENST00000518072 494 ntTSL 29.89□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-217ENST00000523899 527 ntTSL 39□□□□□ -0.975e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ATP6V1H-213ENST00000522159 423 ntTSL 34.15□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC6.93□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 RGL2-245ENST00000491168 2316 ntTSL 218.84■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 RGL2-238ENST00000437840 2687 ntTSL 1 (best)16.12■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 RGL2-243ENST00000483151 2772 ntTSL 215.95■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 42.1
PABPC4Q13310 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.312e-9■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 SEC24C-201ENST00000339365 4513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 SEC24C-203ENST00000465076 4668 ntTSL 1 (best)12.54□□□□□ -0.41e-7■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 SEC24C-202ENST00000345254 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.917e-8■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 CKB-207ENST00000554282 735 ntTSL 224.82■■□□□ 1.567e-8■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 520.47■□□□□ 0.877e-8■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 CKB-202ENST00000553528 1170 ntTSL 220.32■□□□□ 0.847e-8■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 CKB-210ENST00000554989 625 ntTSL 218.76■□□□□ 0.597e-8■■■■■ 41.9
PABPC4Q13310 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.047e-9■■■■■ 41.8
PABPC4Q13310 RPL21-209ENST00000485756 675 ntTSL 24.55□□□□□ -1.682e-31■■■■■ 41.8
PABPC4Q13310 C9orf16-202ENST00000486420 434 ntTSL 514.75□□□□□ -0.054e-29■■■■■ 41.8
PABPC4Q13310 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.598e-11■■■■■ 41.8
PABPC4Q13310 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.271e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.241e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.211e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 SPATA5L1-204ENST00000531970 2464 ntTSL 222.46■■□□□ 1.191e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-206ENST00000477923 512 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 PTDSS2-209ENST00000530029 579 ntTSL 220.22■□□□□ 0.831e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.611e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.481e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.371e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 PTDSS2-211ENST00000531411 624 ntTSL 216.87■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.21e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -01e-11■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 ATG7-213ENST00000446450 2042 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.131e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.151e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 212.98□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.351e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 PTDSS2-205ENST00000526878 3134 ntTSL 212.74□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.371e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 ATG7-202ENST00000354956 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.391e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.411e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 DMBX1-202ENST00000371956 2882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.441e-11■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-18■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 SPATA5L1-203ENST00000531624 944 ntTSL 36.37□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 SPATA5L1-206ENST00000533841 521 ntTSL 36.24□□□□□ -1.411e-9■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 CELSR2-201ENST00000271332 10534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 41.7
PABPC4Q13310 DPP7-210ENST00000483783 958 ntTSL 226.52■■□□□ 1.847e-7■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 DPP7-203ENST00000463619 775 ntTSL 317.38■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 IFITM2-201ENST00000399815 382 ntTSL 316.04■□□□□ 0.163e-27■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 SSR4-205ENST00000447375 427 ntTSL 215.23■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 322.46■■□□□ 1.194e-7■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.274e-7■■■■■ 41.6
PABPC4Q13310 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 56.15□□□□□ -1.421e-323■■■■■ 41.5
PABPC4Q13310 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 FGD6-202ENST00000451107 2232 ntTSL 1 (best)23.84■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 ERP29-205ENST00000553161 916 ntTSL 1 (best)13.43□□□□□ -0.261e-11■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 ERP29-204ENST00000552052 284 ntTSL 312.68□□□□□ -0.381e-11■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.772e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 FGD6-201ENST00000343958 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 41.4
PABPC4Q13310 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.374e-30■■■■■ 41.3
PABPC4Q13310 UROD-219ENST00000494399 1848 ntTSL 215.48■□□□□ 0.074e-30■■■■■ 41.3
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