Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 MDM31YHR194W 1740 nt6.25□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 GPA2YER020W 1350 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 HGH1YGR187C 1185 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 COA1YIL157C 594 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 PEX13YLR191W 1161 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 ECM30YLR436C 3825 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YNL017CYNL017C 339 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 BSC4YNL269W 396 nt6.24□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 SKS1YPL026C 1509 nt6.24□□□□□ -1.41 RIP-Chip
PUF2Q12221 QCR6YFR033C 444 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 LDS1YAL018C 978 nt6.23□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 GEF1YJR040W 2340 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 SIT4YDL047W 936 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 VPS61YDR136C 573 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 TIF2YJL138C 1188 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 TIF1YKR059W 1188 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 YOR200WYOR200W 399 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 MNS1YJR131W 1650 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 WHI2YOR043W 1461 nt6.22□□□□□ -1.41
PUF2Q12221 RRP46YGR095C 672 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 DMA1YHR115C 1251 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 CTF8YHR191C 402 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 ENV7YPL236C 1095 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 NTE1YML059C 5040 nt6.21□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.2□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YEL068CYEL068C 333 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 MEU1YLR017W 1014 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 TSA1YML028W 591 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 AIM33YML087C 939 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 MRPS16YPL013C 366 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 DAP1YPL170W 459 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 GUD1YDL238C 1470 nt6.19□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 ATP4YPL078C 735 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 ADE12YNL220W 1302 nt6.18□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YDR278CYDR278C 318 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YGL235WYGL235W 537 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 TPK1YJL164C 1194 nt6.17□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF2Q12221 CIN4YMR138W 576 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 YPR114WYPR114W 948 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 NPL6YMR091C 1308 nt6.17□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 GDA1YEL042W 1557 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 COX20YDR231C 618 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 PHB1YGR132C 864 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 HMS2YJR147W 1077 nt6.16□□□□□ -1.42 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLR126CYLR126C 756 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 HMT1YBR034C 1047 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 PZF1YPR186C 1290 nt6.16□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 BUD9YGR041W 1644 nt6.15□□□□□ -1.42
PUF2Q12221 PYK2YOR347C 1521 nt6.15□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 AIM3YBR108W 2844 nt6.14□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDL129WYDL129W 876 nt6.14□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRS2YER099C 957 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 SEN34YAR008W 828 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 SRN2YLR119W 642 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 DUS4YLR405W 1104 nt6.14□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 HST3YOR025W 1344 nt6.14□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 DFM1YDR411C 1026 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 ERP2YAL007C 648 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 MOD5YOR274W 1287 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 RAD24YER173W 1980 nt6.13□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YDL144CYDL144C 1071 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 HAP3YBL021C 435 nt6.12□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 NSE5YML023C 1671 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 FET4YMR319C 1659 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 ATG4YNL223W 1485 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 BCY1YIL033C 1251 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YML012C-AYML012C-A 378 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 SHP1YBL058W 1272 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 KKQ8YKL168C 2175 nt6.11□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 SKY1YMR216C 2229 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YML133CYML133C 4125 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 COR1YBL045C 1374 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 TEP1YNL128W 1305 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 SPO7YAL009W 780 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 YPL071CYPL071C 471 nt6.1□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 TPO3YPR156C 1869 nt6.1□□□□□ -1.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 CHS5YLR330W 2016 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 UGX2YDL169C 672 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 LEU5YHR002W 1074 nt6.09□□□□□ -1.43
PUF2Q12221 GTT3YEL017W 1014 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 SNN1YNL086W 309 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 MCM3YEL032W 2916 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 PHO3YBR092C 1404 nt6.08□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ELP3YPL086C 1674 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 ISN1YOR155C 1353 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 PET112YBL080C 1626 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 PRI2YKL045W 1587 nt6.07□□□□□ -1.44
PUF2Q12221 VMA2YBR127C 1554 nt6.07□□□□□ -1.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPT3YDR394W 1287 nt6.07□□□□□ -1.44
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