Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 FBA1YKL060C 1080 nt6.16□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 MOD5YOR274W 1287 nt6.16□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 FIT2YOR382W 462 nt6.16□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YBR113WYBR113W 483 nt6.16□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 YNL095CYNL095C 1929 nt6.15□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.15□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 RHO3YIL118W 696 nt6.15□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 MIA40YKL195W 1212 nt6.15□□□□□ -1.42
NFI1Q12216 AVO1YOL078W 3531 nt6.15□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 MFG1YDL233W 1377 nt6.15□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 PYC2YBR218C 3543 nt6.15□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 PWP1YLR196W 1731 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 PYC1YGL062W 3537 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 MDH3YDL078C 1032 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YGR176WYGR176W 348 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 SWD1YAR003W 1281 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 SML1YML058W 315 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 MRPL10YNL284C 969 nt6.14□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 KEX2YNL238W 2445 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YJL211CYJL211C 444 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YOX1YML027W 1158 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 CRP1YHR146W 1398 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 GSY2YLR258W 2118 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 RAD53YPL153C 2466 nt6.13□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 UTR2YEL040W 1404 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 SQT1YIR012W 1296 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YJL193WYJL193W 1209 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 ACS2YLR153C 2052 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 ATG17YLR423C 1254 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 RPR1RPR1 369 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YNL120CYNL120C 486 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YOL046CYOL046C 675 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 CLP1YOR250C 1338 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YPR076WYPR076W 375 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 THI2YBR240C 1353 nt6.12□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 UTP9YHR196W 1728 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 MSY1YPL097W 1479 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 AGX1YFL030W 1158 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 PRE5YMR314W 705 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 ZIM17YNL310C 525 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 EPS1YIL005W 2106 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 BUD14YAR014C 2130 nt6.11□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 DID2YKR035W-A 615 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YKR073CYKR073C 321 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 KSH1YNL024C-A 219 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 RFC4YOL094C 972 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 snR32snR32 188 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 CCC2YDR270W 3015 nt6.1□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 HOS1YPR068C 1413 nt6.09□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 COX10YPL172C 1389 nt6.09□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 RPP1YHR062C 882 nt6.09□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 YJR146WYJR146W 354 nt6.09□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 BPL1YDL141W 2073 nt6.09□□□□□ -1.43
NFI1Q12216 CYS4YGR155W 1524 nt6.09□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 PRY3YJL078C 2646 nt6.09□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 DPB2YPR175W 2070 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 NPL6YMR091C 1308 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 MID1YNL291C 1647 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YKL077WYKL077W 1179 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YJU2YKL095W 837 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YLR312CYLR312C 1197 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 REC114YMR133W 1287 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 TAE1YBR261C 699 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 VRP1YLR337C 2454 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 ZWF1YNL241C 1518 nt6.08□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 RGT1YKL038W 3513 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 PHM8YER037W 966 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YLR123CYLR123C 330 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 OGG1YML060W 1131 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 MRPL23YOR150W 492 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YOR268CYOR268C 399 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 DBF4YDR052C 2115 nt6.07□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 PRP24YMR268C 1335 nt6.06□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 PPH21YDL134C 1110 nt6.06□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 TSR3YOR006C 942 nt6.06□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 MKC7YDR144C 1791 nt6.06□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 SSK22YCR073C 3996 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 ECM7YLR443W 1347 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 ARA2YMR041C 1008 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YPL257WYPL257W 582 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 RRT2YBR246W 1164 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YLL067CYLL067C 3618 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 MNN2YBR015C 1794 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 MCX1YBR227C 1563 nt6.05□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 EFM3YJR129C 1020 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YKL102CYKL102C 306 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 COX17YLL009C 210 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 YML131WYML131W 1098 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 CAM1YPL048W 1248 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 PDB1YBR221C 1101 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 CYK3YDL117W 2658 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 RIM101YHL027W 1878 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 NOP7YGR103W 1818 nt6.04□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 VTC2YFL004W 2487 nt6.03□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 ERC1YHR032W 1746 nt6.03□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 BUD32YGR262C 786 nt6.03□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 DOM34YNL001W 1161 nt6.03□□□□□ -1.44
NFI1Q12216 LGE1YPL055C 999 nt6.03□□□□□ -1.44
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