Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PTPN11Q06124 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PTPN11Q06124 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTPN11Q06124 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTPN11Q06124 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms