Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNC1Q01954 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BNC1Q01954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BNC1Q01954 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 827.8 ms