Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 RVB2YPL235W 1416 nt5.96□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YPR196WYPR196W 1413 nt5.96□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 ATF1YOR377W 1578 nt5.96□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YOL036WYOL036W 2286 nt5.96□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 POX1YGL205W 2247 nt5.95□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YDR514CYDR514C 1452 nt5.95□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 WHI2YOR043W 1461 nt5.95□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 CRF1YDR223W 1404 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 MNN5YJL186W 1761 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 BCY1YIL033C 1251 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 VPS24YKL041W 675 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 ATP4YPL078C 735 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 GLN1YPR035W 1113 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 ERG1YGR175C 1491 nt5.94□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 TIM22YDL217C 624 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 TSR3YOR006C 942 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 IFA38YBR159W 1044 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 CNE1YAL058W 1509 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YLL067CYLL067C 3618 nt5.93□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YBR284WYBR284W 2394 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 HVG1YER039C 750 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 STB5YHR178W 2232 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 HST3YOR025W 1344 nt5.92□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 HXT17YNR072W 1695 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 HIS7YBR248C 1659 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 LDS1YAL018C 978 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 PSR2YLR019W 1194 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 TSA1YML028W 591 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 KKQ8YKL168C 2175 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 NSE5YML023C 1671 nt5.91□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 DSF1YEL070W 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 YNR073CYNR073C 1509 nt5.9□□□□□ -1.46
PRP38Q00723 PDR18YNR070W 4002 nt5.9□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 PYK2YOR347C 1521 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 RGD1YBR260C 2001 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YET3YDL072C 612 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 OAC1YKL120W 975 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 QRI5YLR204W 336 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MRPS12YNR036C 462 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 VPS4YPR173C 1314 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 HXK2YGL253W 1461 nt5.89□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MAK31YCR020C-A 267 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 CDC34YDR054C 888 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YEL068CYEL068C 333 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YHM2YMR241W 945 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 CSC1YLR241W 2349 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 FRS2YFL022C 1512 nt5.88□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MRPS16YPL013C 366 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 HXT2YMR011W 1626 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MDM31YHR194W 1740 nt5.87□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 VPS5YOR069W 2028 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 RPE1YJL121C 717 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 VMA4YOR332W 702 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YPR114WYPR114W 948 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 KEL1YHR158C 3495 nt5.86□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 PRE3YJL001W 648 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 RPS28AYOR167C 204 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YIL055CYIL055C 1884 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MRC1YCL061C 3291 nt5.85□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 ALT2YDR111C 1524 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 MCM3YEL032W 2916 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YDR015CYDR015C 240 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 RPN11YFR004W 921 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YHL018WYHL018W 363 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 CAF40YNL288W 1122 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 YNR040WYNR040W 771 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 POP1YNL221C 2628 nt5.84□□□□□ -1.47
PRP38Q00723 GPB2YAL056W 2643 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 PXL1YKR090W 2121 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 YDL218WYDL218W 954 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 HAP3YBL021C 435 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 AVO2YMR068W 1281 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 LDB19YOR322C 2457 nt5.83□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 ICL1YER065C 1674 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 ZRT2YLR130C 1269 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 GAT1YFL021W 1533 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 ATG4YNL223W 1485 nt5.82□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 CYC8YBR112C 2901 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 MOG1YJR074W 657 nt5.81□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 AFG1YEL052W 1530 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 MED6YHR058C 888 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 YJU3YKL094W 942 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 YNL285WYNL285W 372 nt5.8□□□□□ -1.48
PRP38Q00723 JIP4YDR475C 2631 nt5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 1679.3 ms