Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 MSS116YDR194C 1995 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 ILV1YER086W 1731 nt6.25□□□□□ -1.41
SEC28P40509 SIT1YEL065W 1887 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 snR82snR82 268 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 CUP2YGL166W 678 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YGL235WYGL235W 537 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 TFG2YGR005C 1203 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YJL211CYJL211C 444 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 PEX13YLR191W 1161 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 RPL21AYBR191W 483 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 TAE1YBR261C 699 nt6.24□□□□□ -1.41
SEC28P40509 RAD59YDL059C 717 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 BUG1YDL099W 1026 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YDR187CYDR187C 519 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 SOH1YGL127C 384 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YPL136WYPL136W 369 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 NPL6YMR091C 1308 nt6.23□□□□□ -1.41
SEC28P40509 MRPL1YDR116C 858 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 GPI11YDR302W 660 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 YUR1YJL139C 1287 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 JJJ3YJR097W 519 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 OSW2YLR054C 2175 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 AMD2YDR242W 1650 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 DUG1YFR044C 1446 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 DDC1YPL194W 1839 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 VMS1YDR049W 1899 nt6.22□□□□□ -1.41
SEC28P40509 MPC2YHR162W 390 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YMR122CYMR122C 375 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YMR252CYMR252C 405 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 GLC8YMR311C 690 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YBL112CYBL112C 318 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 SEC18YBR080C 2277 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 GLN3YER040W 2193 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 SUB2YDL084W 1341 nt6.21□□□□□ -1.42
SEC28P40509 PAP1YKR002W 1707 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 SDH4YDR178W 546 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 OPI7YDR360W 435 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 COA1YIL157C 594 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YIR042CYIR042C 711 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YNL200CYNL200C 741 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 SGF29YCL010C 780 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 ARO10YDR380W 1908 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 ACS1YAL054C 2142 nt6.2□□□□□ -1.42
SEC28P40509 TDH2YJR009C 999 nt6.19□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YNL247WYNL247W 2304 nt6.19□□□□□ -1.42
SEC28P40509 AIM17YHL021C 1398 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 CRF1YDR223W 1404 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 GEF1YJR040W 2340 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 TMT1YER175C 900 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 ECM14YHR132C 1293 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 DUS4YLR405W 1104 nt6.18□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YMR155WYMR155W 1644 nt6.17□□□□□ -1.42
SEC28P40509 ISC1YER019W 1434 nt6.17□□□□□ -1.42
SEC28P40509 RVB2YPL235W 1416 nt6.17□□□□□ -1.42
SEC28P40509 MDH1YKL085W 1005 nt6.17□□□□□ -1.42
SEC28P40509 AVT4YNL101W 2142 nt6.17□□□□□ -1.42
SEC28P40509 CDC1YDR182W 1476 nt6.16□□□□□ -1.42
SEC28P40509 YIL055CYIL055C 1884 nt6.16□□□□□ -1.42
SEC28P40509 RRS1YOR294W 612 nt6.16□□□□□ -1.42
SEC28P40509 MCH1YDL054C 1461 nt6.15□□□□□ -1.42
SEC28P40509 PSR2YLR019W 1194 nt6.15□□□□□ -1.42
SEC28P40509 VHT1YGR065C 1782 nt6.15□□□□□ -1.43
SEC28P40509 EEB1YPL095C 1371 nt6.15□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YPR196WYPR196W 1413 nt6.15□□□□□ -1.43
SEC28P40509 TEL2YGR099W 2067 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YLL067CYLL067C 3618 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 BCY1YIL033C 1251 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 VPS24YKL041W 675 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YJU2YKL095W 837 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 SRY1YKL218C 981 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 SLD7YOR060C 774 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 TKL1YPR074C 2043 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 ATG23YLR431C 1362 nt6.14□□□□□ -1.43
SEC28P40509 TPO3YPR156C 1869 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 SKN1YGR143W 2316 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YDR278CYDR278C 318 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 LDS1YAL018C 978 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 DRE2YKR071C 1047 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 UTP9YHR196W 1728 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 CEF1YMR213W 1773 nt6.13□□□□□ -1.43
SEC28P40509 PMP3YDR276C 168 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 RPT3YDR394W 1287 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 ERG1YGR175C 1491 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 BNS1YGR230W 414 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YHR145CYHR145C 357 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 REV7YIL139C 738 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 CIS3YJL158C 684 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 IMA5YJL216C 1746 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 ARA2YMR041C 1008 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 TSR3YOR006C 942 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 CWC27YPL064C 906 nt6.12□□□□□ -1.43
SEC28P40509 NOP7YGR103W 1818 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 RRP9YPR137W 1722 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YCK1YHR135C 1617 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 HST3YOR025W 1344 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 GPB2YAL056W 2643 nt6.11□□□□□ -1.43
SEC28P40509 YKR073CYKR073C 321 nt6.11□□□□□ -1.43
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