Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC13P31276 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC13P31276 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC13P31276 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC13P31276 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms