Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXA7P31268 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXA7P31268 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXA7P31268 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXA7P31268 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms