Protein–RNA interactions for Protein: P15559

NQO1, NAD(P)H dehydrogenase [quinone] 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NQO1P15559 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NQO1P15559 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NQO1P15559 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NQO1P15559 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NQO1P15559 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NQO1P15559 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NQO1P15559 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NQO1P15559 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NQO1P15559 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NQO1P15559 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NQO1P15559 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NQO1P15559 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NQO1P15559 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NQO1P15559 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NQO1P15559 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NQO1P15559 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NQO1P15559 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NQO1P15559 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NQO1P15559 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NQO1P15559 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NQO1P15559 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NQO1P15559 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NQO1P15559 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NQO1P15559 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NQO1P15559 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NQO1P15559 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NQO1P15559 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NQO1P15559 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NQO1P15559 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NQO1P15559 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NQO1P15559 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NQO1P15559 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms