Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FCER1AP12319 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FCER1AP12319 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FCER1AP12319 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms