Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 RHBDL1-204ENST00000561556 796 ntTSL 325.31■■□□□ 1.642e-10■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.152e-10■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 519.31■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 SFSWAP-203ENST00000535236 5593 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.542e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 SPG7-213ENST00000566221 734 ntTSL 315.89■□□□□ 0.132e-12■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 GMDS-AS1-214ENST00000534468 724 ntTSL 313.2□□□□□ -0.36e-11■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 USP3-215ENST00000559771 561 ntTSL 46.39□□□□□ -1.392e-6■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.416e-11■■■■■ 215.4
SF3B1O75533 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 214.6
SF3B1O75533 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 214.6
SF3B1O75533 ZNF766-209ENST00000601711 588 ntTSL 514.1□□□□□ -0.154e-10■■■■■ 214.2
SF3B1O75533 PACS2-211ENST00000551692 3453 ntTSL 213.86□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 214.2
SF3B1O75533 ZNF766-203ENST00000593703 554 ntTSL 413.29□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 214.2
SF3B1O75533 ZNF766-206ENST00000599581 2065 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.794e-10■■■■■ 214.2
SF3B1O75533 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.34e-10■■■■■ 214.2
SF3B1O75533 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CNTNAP2-205ENST00000625365 676 ntTSL 525.63■■□□□ 1.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM129B-207ENST00000484348 654 ntTSL 1 (best)25.31■■□□□ 1.642e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.18■■□□□ 1.622e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 525.02■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 NDUFS8-205ENST00000525419 561 ntTSL 323.71■■□□□ 1.392e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 POLR3E-204ENST00000561494 575 ntTSL 323.45■■□□□ 1.342e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.122e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 POLR3E-214ENST00000565358 565 ntTSL 421.63■■□□□ 1.052e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 POLR3E-205ENST00000563024 473 ntTSL 421.63■■□□□ 1.052e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.972e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-207ENST00000491488 602 ntTSL 520.89■□□□□ 0.932e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 POLR3E-212ENST00000564883 560 ntTSL 420.34■□□□□ 0.852e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CHD1L-209ENST00000492728 662 ntTSL 220.31■□□□□ 0.842e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-204ENST00000480596 1893 ntTSL 219.02■□□□□ 0.632e-11■■■■■ 213.9
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SF3B1O75533 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-202ENST00000377824 1844 ntTSL 218.23■□□□□ 0.512e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-203ENST00000460882 1080 ntTSL 1 (best)17.88■□□□□ 0.452e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 217.32■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 MAST1-207ENST00000590883 1717 ntTSL 517.06■□□□□ 0.322e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 316.87■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 NDUFS8-214ENST00000531796 615 ntTSL 316.84■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.282e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM53A-203ENST00000463238 558 ntTSL 316.61■□□□□ 0.252e-11■■■■■ 213.9
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SF3B1O75533 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 216.3■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 213.9
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SF3B1O75533 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 315.76■□□□□ 0.112e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-209ENST00000494290 1593 ntTSL 515.7■□□□□ 0.12e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.091e-21■■■■■ 213.9
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SF3B1O75533 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.052e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-11■■■■■ 213.9
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SF3B1O75533 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-208ENST00000479751 900 ntTSL 314.87□□□□□ -0.032e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SMAD3-213ENST00000560175 542 ntTSL 414.42□□□□□ -0.12e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 AC009403.2-204ENST00000637398 2744 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ZC3H18-204ENST00000564161 4654 ntTSL 214.14□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CNTNAP2-219ENST00000637150 1767 ntTSL 514.07□□□□□ -0.162e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 MCM3AP-204ENST00000467026 2671 ntTSL 1 (best)13.76□□□□□ -0.212e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.232e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-207ENST00000475644 2481 ntTSL 1 (best)13.52□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ZNF585A-206ENST00000588723 670 ntTSL 313.49□□□□□ -0.252e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 GRHPR-210ENST00000497693 4762 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 AC012309.1-201ENST00000588873 389 ntAPPRIS P1 TSL 512.59□□□□□ -0.392e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CCDC125-204ENST00000460090 2273 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.422e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 MIR3945HG-201ENST00000510284 576 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.462e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.462e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CCDC125-205ENST00000511257 1735 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.582e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 AC009403.2-203ENST00000635770 2977 ntTSL 510.88□□□□□ -0.672e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 STX17-203ENST00000525342 675 ntTSL 510.78□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-211ENST00000495667 759 ntTSL 510.77□□□□□ -0.692e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-205ENST00000471631 752 ntTSL 510.65□□□□□ -0.72e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-206ENST00000472605 941 ntTSL 510.47□□□□□ -0.732e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 CLEC16A-201ENST00000261657 4351 ntTSL 410.32□□□□□ -0.762e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ZNF585A-203ENST00000392157 3190 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 MIR3945HG-202ENST00000511703 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 ZNF585A-204ENST00000587817 2316 ntTSL 29.78□□□□□ -0.842e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-204ENST00000463889 728 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 SPAG8-203ENST00000460836 678 ntTSL 39.67□□□□□ -0.862e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 DUS2-204ENST00000562246 736 ntTSL 29.57□□□□□ -0.882e-11■■■■■ 213.9
SF3B1O75533 AC009403.2-202ENST00000636307 3956 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.912e-11■■■■■ 213.9
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