RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377824.8

GRHPR-202, Transcript of glyoxylate and hydroxypyruvate reductase, humanhuman

TSL 2

Gene GRHPR, Length 1,844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHPR-202ENST00000377824 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.22■■■■□ 3.87
GRHPR-202ENST00000377824 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.16■■■■□ 3.06
GRHPR-202ENST00000377824 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33■■■□□ 2.87
GRHPR-202ENST00000377824 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.44■■■□□ 2.78
GRHPR-202ENST00000377824 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.35■■■□□ 2.77
GRHPR-202ENST00000377824 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.16■■■□□ 2.74
GRHPR-202ENST00000377824 ABCC9O60706 1549 aa32.04■■■□□ 2.72
GRHPR-202ENST00000377824 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.96■■■□□ 2.71
GRHPR-202ENST00000377824 NACADO15069 1562 aa31.73■■■□□ 2.67
GRHPR-202ENST00000377824 SCRIBQ14160 1630 aa31.43■■■□□ 2.62
GRHPR-202ENST00000377824 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.43■■■□□ 2.62
GRHPR-202ENST00000377824 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
GRHPR-202ENST00000377824 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.83■■■□□ 2.53
GRHPR-202ENST00000377824 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
GRHPR-202ENST00000377824 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.42■■■□□ 2.46
GRHPR-202ENST00000377824 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.41■■■□□ 2.46
GRHPR-202ENST00000377824 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
GRHPR-202ENST00000377824 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.3■■■□□ 2.44
GRHPR-202ENST00000377824 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.23■■■□□ 2.43
GRHPR-202ENST00000377824 SMARCA4P51532 1647 aa30.13■■■□□ 2.41
GRHPR-202ENST00000377824 WIZO95785 1651 aa30.11■■■□□ 2.41
GRHPR-202ENST00000377824 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.82■■■□□ 2.36
GRHPR-202ENST00000377824 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
GRHPR-202ENST00000377824 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.73■■■□□ 2.35
GRHPR-202ENST00000377824 SMARCA2P51531 1590 aa29.58■■■□□ 2.33
GRHPR-202ENST00000377824 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.54■■■□□ 2.32
GRHPR-202ENST00000377824 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
GRHPR-202ENST00000377824 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.46■■■□□ 2.31
GRHPR-202ENST00000377824 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
GRHPR-202ENST00000377824 HMGXB3Q12766 1538 aa29.26■■■□□ 2.28
GRHPR-202ENST00000377824 NCAPD3P42695 1498 aa29.23■■■□□ 2.27
GRHPR-202ENST00000377824 TRIM41Q8WV44 630 aa29.21■■■□□ 2.27
GRHPR-202ENST00000377824 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.02■■■□□ 2.24
GRHPR-202ENST00000377824 ABCC8Q09428 1581 aa28.95■■■□□ 2.22
GRHPR-202ENST00000377824 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
GRHPR-202ENST00000377824 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.69■■■□□ 2.18
GRHPR-202ENST00000377824 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
GRHPR-202ENST00000377824 PRDM2Q13029 1718 aa28.66■■■□□ 2.18
GRHPR-202ENST00000377824 CFTRP13569 1480 aa28.66■■■□□ 2.18
GRHPR-202ENST00000377824 SYNJ1O43426 1573 aa28.6■■■□□ 2.17
GRHPR-202ENST00000377824 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.51■■■□□ 2.15
GRHPR-202ENST00000377824 TOP2BQ02880 1626 aa28.49■■■□□ 2.15
GRHPR-202ENST00000377824 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.47■■■□□ 2.15
GRHPR-202ENST00000377824 EEA1Q15075 1411 aa28.47■■■□□ 2.15
GRHPR-202ENST00000377824 SOGA1O94964 1423 aa28.41■■■□□ 2.14
GRHPR-202ENST00000377824 CUX1P39880 1505 aa28.32■■■□□ 2.12
GRHPR-202ENST00000377824 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.28■■■□□ 2.12
GRHPR-202ENST00000377824 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.27■■■□□ 2.12
GRHPR-202ENST00000377824 EHMT2Q96KQ7 1210 aa28.26■■■□□ 2.11
GRHPR-202ENST00000377824 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.25■■■□□ 2.11
GRHPR-202ENST00000377824 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.23■■■□□ 2.11
GRHPR-202ENST00000377824 NESP48681 1621 aa28.19■■■□□ 2.1
GRHPR-202ENST00000377824 KIF21BO75037 1637 aa28.09■■■□□ 2.09
GRHPR-202ENST00000377824 GOLGA3Q08378 1498 aa28.09■■■□□ 2.09
GRHPR-202ENST00000377824 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.08■■■□□ 2.09
GRHPR-202ENST00000377824 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.06■■■□□ 2.08
GRHPR-202ENST00000377824 HRCP23327 699 aa28.06■■■□□ 2.08
GRHPR-202ENST00000377824 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.03■■■□□ 2.08
GRHPR-202ENST00000377824 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.02■■■□□ 2.08
GRHPR-202ENST00000377824 TNIKQ9UKE5 1360 aa28.01■■■□□ 2.07
GRHPR-202ENST00000377824 KIF27Q86VH2 1401 aa28■■■□□ 2.07
GRHPR-202ENST00000377824 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28■■■□□ 2.07
GRHPR-202ENST00000377824 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.96■■■□□ 2.07
GRHPR-202ENST00000377824 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
GRHPR-202ENST00000377824 TOPBP1Q92547 1522 aa27.94■■■□□ 2.06
GRHPR-202ENST00000377824 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.92■■■□□ 2.06
GRHPR-202ENST00000377824 CEP162Q5TB80 1403 aa27.89■■■□□ 2.05
GRHPR-202ENST00000377824 CUX2O14529 1486 aa27.86■■■□□ 2.05
GRHPR-202ENST00000377824 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.86■■■□□ 2.05
GRHPR-202ENST00000377824 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.84■■■□□ 2.05
GRHPR-202ENST00000377824 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
GRHPR-202ENST00000377824 PRXQ9BXM0 1461 aa27.82■■■□□ 2.04
GRHPR-202ENST00000377824 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
GRHPR-202ENST00000377824 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.75■■■□□ 2.03
GRHPR-202ENST00000377824 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.72■■■□□ 2.03
GRHPR-202ENST00000377824 WDR97A6NE52 1622 aa27.68■■■□□ 2.02
GRHPR-202ENST00000377824 IGF1RP08069 1367 aa27.66■■■□□ 2.02
GRHPR-202ENST00000377824 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.65■■■□□ 2.02
GRHPR-202ENST00000377824 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
GRHPR-202ENST00000377824 CLIP1P30622 1438 aa27.62■■■□□ 2.01
GRHPR-202ENST00000377824 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.56■■■□□ 2
GRHPR-202ENST00000377824 CUL7Q14999 1698 aa27.54■■■□□ 2
GRHPR-202ENST00000377824 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.52■■■□□ 2
GRHPR-202ENST00000377824 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
GRHPR-202ENST00000377824 ERCC6Q03468 1493 aa27.5■■□□□ 1.99
GRHPR-202ENST00000377824 WDR62O43379 1518 aa27.49■■□□□ 1.99
GRHPR-202ENST00000377824 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.45■■□□□ 1.98
GRHPR-202ENST00000377824 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
GRHPR-202ENST00000377824 VPS8Q8N3P4 1428 aa27.42■■□□□ 1.98
GRHPR-202ENST00000377824 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
GRHPR-202ENST00000377824 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
GRHPR-202ENST00000377824 PBRM1Q86U86 1689 aa27.34■■□□□ 1.97
GRHPR-202ENST00000377824 IFT140Q96RY7 1462 aa27.34■■□□□ 1.97
GRHPR-202ENST00000377824 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
GRHPR-202ENST00000377824 ARAP1Q96P48 1450 aa27.3■■□□□ 1.96
GRHPR-202ENST00000377824 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.3■■□□□ 1.96
GRHPR-202ENST00000377824 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.25■■□□□ 1.95
GRHPR-202ENST00000377824 APLP2Q06481 763 aa27.22■■□□□ 1.95
GRHPR-202ENST00000377824 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.21■■□□□ 1.956e-7■■■■□ 20.2
GRHPR-202ENST00000377824 GRIN2BQ13224 1484 aa27.2■■□□□ 1.94
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