Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SEC24CP53992 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms