Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-206ENST00000420627 8225 ntTSL 512.89□□□□□ -0.351e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.431e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.511e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 FLNA-219ENST00000610817 7595 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-7■□□□□ 8.5
ILF3Q12906 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 320.13■□□□□ 0.811e-7■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.71e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-211ENST00000496465 577 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.331e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CDR2-207ENST00000569045 826 ntTSL 516.62■□□□□ 0.251e-6■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 CDR2-206ENST00000567406 567 ntTSL 415.24■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 TM2D1-203ENST00000371178 1056 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CCDC69-205ENST00000521308 3323 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.171e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-210ENST00000494926 544 ntTSL 511.5□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CCDC69-203ENST00000519448 3252 ntTSL 1 (best)10.58□□□□□ -0.721e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CCDC69-202ENST00000518189 2864 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.741e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-202ENST00000371177 3218 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CCDC69-201ENST00000355417 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 TM2D1-205ENST00000468586 637 ntTSL 38.01□□□□□ -1.131e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 44.47□□□□□ -1.691e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC10.8□□□□□ -0.681e-15■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 SHC1-209ENST00000444664 1305 ntTSL 516.6■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 SHC1-211ENST00000490667 727 ntTSL 213.09□□□□□ -0.313e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 SHC1-203ENST00000368449 2879 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.583e-6■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-9■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 312.75□□□□□ -0.372e-6■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 HTD2-207ENST00000498618 557 ntTSL 420.04■□□□□ 0.87e-13■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.387e-13■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.367e-13■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.117e-13■□□□□ 8.4
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ILF3Q12906 HTD2-204ENST00000476007 847 ntTSL 210.43□□□□□ -0.747e-13■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 RPP14-201ENST00000295959 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.817e-13■□□□□ 8.4
ILF3Q12906 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.231e-8■□□□□ 8.3
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ILF3Q12906 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.182e-6■□□□□ 8.3
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ILF3Q12906 FAM3C-203ENST00000426156 662 ntTSL 527.05■■□□□ 1.925e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.911e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.785e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 317.89■□□□□ 0.451e-7■□□□□ 8.3
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ILF3Q12906 FAM3C-202ENST00000412653 561 ntTSL 416.62■□□□□ 0.255e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-210ENST00000467982 1855 ntTSL 515.62■□□□□ 0.095e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 ETFB-203ENST00000593992 603 ntTSL 215.49■□□□□ 0.075e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 ETFB-205ENST00000596253 575 ntTSL 314.77□□□□□ -0.055e-6■□□□□ 8.3
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ILF3Q12906 TARS2-212ENST00000480070 832 ntTSL 514.08□□□□□ -0.165e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-201ENST00000369051 2106 ntTSL 513.39□□□□□ -0.275e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.335e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)11.98□□□□□ -0.498e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-207ENST00000461764 1841 ntTSL 511.91□□□□□ -0.55e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-208ENST00000463555 852 ntTSL 511.77□□□□□ -0.535e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.578e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-218ENST00000485087 1738 ntTSL 511.3□□□□□ -0.65e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.615e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.648e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PPARD-203ENST00000360694 3747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.645e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.681e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-204ENST00000369064 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PPARD-204ENST00000418635 3453 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.695e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-211ENST00000468167 1767 ntTSL 510.14□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PPARD-201ENST00000311565 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 EIF3K-212ENST00000593062 704 ntTSL 29.54□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-208ENST00000462588 1826 ntTSL 1 (best)9.5□□□□□ -0.895e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-210ENST00000467309 1313 ntTSL 1 (best)9.24□□□□□ -0.935e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 AC016723.1-202ENST00000436982 643 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.965e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 EIF3K-206ENST00000588299 524 ntTSL 29.01□□□□□ -0.975e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-202ENST00000373775 2199 ntTSL 58.85□□□□□ -0.995e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-205ENST00000437147 2295 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.015e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 SON-207ENST00000436227 5269 ntAPPRIS P1 TSL 58.38□□□□□ -1.078e-17■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TARS2-207ENST00000462578 609 ntTSL 38.34□□□□□ -1.075e-6■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 8.3
ILF3Q12906 TAF1-204ENST00000423759 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.08□□□□□ -1.125e-6■□□□□ 8.3
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