Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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