Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DCLRE1BQ9H816 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DCLRE1BQ9H816 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCLRE1BQ9H816 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms