Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TXNDC17Q9BRA2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TXNDC17Q9BRA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TXNDC17Q9BRA2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms