Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HHIPQ96QV1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HHIPQ96QV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HHIPQ96QV1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms