Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRELD1Q96HD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRELD1Q96HD1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CRELD1Q96HD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms